La Battle Phase o fase de batalla es la fase en la que la batalla se lleva a cabo. Una Battle Phase puede llevarse a cabo en cada turno, excepto en el primer turno del duelo, después de la Main Phase 1 del jugador que este en su turno. Se divide en cuatro áreas principales:
Paso de inicio (Start Step)
Paso de batalla (Battle Step)
Paso daños (Damage Step)
Paso final (End Step)
Paso de inicio (Start Step)
Paso de batalla (Battle Step)
Paso daños (Damage Step)
Paso final (End Step)